Los principales problemas de los softphones gratuitos son que muchas veces estas aplicaciones no funcionan de manera estable (debido a la variedad de dispositivos y sistemas operativos, su desarrollo y actualización es muy difícil), requieren atención cambiante al realizar una llamada y tienen una interfaz inusual, deben estar en constante funcionamiento y gastar la batería de los dispositivos móviles, no admiten la conexión simultánea de varios números, es posible que no permitan el uso de cuentas de diferentes operadores de telecomunicaciones y su uso simultáneo.